Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NficP70255 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NficP70255 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NficP70255 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NficP70255 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NficP70255 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms