Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms