Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crabp1P62965 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crabp1P62965 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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