Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3P62908 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3P62908 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3P62908 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms