Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ufm1P61961 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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