Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms