Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms