Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf2P59222 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms