Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms