Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms