Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms