Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd4P58467 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms