Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms