Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms