Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms