Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcanP55066 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms