Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a1P55014 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms