Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms