Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp1P52624 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms