Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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