Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms