Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FmodP50608 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FmodP50608 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FmodP50608 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms