Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx3P50481 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms