Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms