Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc3P49135 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms