Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms