Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfaP48030 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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