Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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