Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sipa1P46062 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms