Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms