Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a2P43006 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms