Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfsf9P41274 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfsf9P41274 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tnfsf9P41274 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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