Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf2P39429 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms