Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf1P39428 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms