Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms