Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms