Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger1P35375 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger1P35375 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms