Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms