Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms