Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcdP28867 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcdP28867 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms