Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms