Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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