Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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