Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxraP28700 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxraP28700 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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