Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apex1P28352 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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