Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa5P28312 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms