Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aco1P28271 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aco1P28271 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms