Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms