Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms