Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms